布拉格机场每天要处理200多趟航班（有时候高峰期近300趟），并且有约45至50家航空公司运营直达班机，定期和包机，前往世界各地（38个国家）的83个目的地，从而成为了一座较大的机场。冬季日程中的航班数往往比夏季日程中的要少。
每月机场乘客数多达120万——大约相当于布拉格自身的居民数量。根据通过航站楼的乘客数，瓦茨拉夫·哈维尔国际机场（Václav Havel Airport）是欧洲前30名，中欧第2大机场。之所有受欢迎是因为其廉价航空公司的数量，而这些航空公司得益于布拉格所在地中欧位置。不用说，布拉格机场有一些附近机场的主要竞争对手，如：维也纳（Vienna）、慕尼黑（Munich）、纽伦堡（Nuremberg ）和德累斯顿（Dresden），有很多寻求更廉价航班的乘客选择了从那些机场离开，而不是从布拉格离开。另一个减少了布拉格机场航班数的因素是捷克国有航空公司捷克航空公司巨幅减少了去往很多目的航班数量。近来影响乘客数的因素是有些有兴趣飞往布拉格的廉价航空公司无法与机场达成协议，因为布拉格机场仍然收费很高，因此谈判失败，例如，瑞安航空公司（Ryanair）。
布拉格机场的主要航空公司是捷克航空公司（ČSA），是天合联盟（SkyTeam Alliance）成员，运营的航班多数都前往欧洲及俄罗斯的目的地。在2012和2013年，这家公司与阿提哈德航空公司（Etihad Airways）和大韩航空公司合作将其服务扩大到亚洲和澳大利亚（它们实际上购买了这家公司44%的股份，可能避免了公司破产）。
目前从布拉格机场始发的直达航班飞往：阿布扎比（Abu Dhabi），阿拉木图（Almaty），阿姆斯特丹（Amsterdam），雅典（Athens），巴库（Baku），巴塞罗那（Barcelona），巴里（Bari），巴塞尔-米卢斯机场（Basel / Mulhouse），柏林-泰格尔机场（Berlin / Tegel），布里斯托尔（Bristol），布鲁塞尔（Brussels），布加勒斯特-奥托佩尼机场（Bucharest / Otopeni），布达佩斯（Budapest），科隆（Cologne），哥本哈根（Copenhagen），顿涅茨克（Donetsk），迪拜（Dubai），都柏林（Dublin），杜塞尔多夫（Dusseldorf），爱丁堡（Edinburgh），叶卡特琳堡（Ekaterinburg），法兰克福（Frankfurt, ），日内瓦（Geneva），汉堡（Hamburg），赫尔辛基（Helsinki），伊斯坦布尔（Istanbul），喀山（Kazan），基辅-鲍里斯波尔机场（Kiev / Borispol），科希策（Kosice），克拉斯诺达尔（Krasnodar），利兹（Leeds），里斯本（Lisbon），伦敦-盖特威克机场（London / Gatwick），伦敦-希思罗机场（London / Heathrow），伦敦-卢顿机场（London / Luton），伦敦-斯坦斯特德机场（London / Stansted），里昂（Lyon），马德里（Madrid），曼彻斯特（Manchester），马赛（Marseille），米兰-贝加莫机场（Milan / Bergamo），米兰-马尔彭萨机场 (Milan/Malpensa)，明斯克（Minsk），莫斯科-谢列梅捷沃机场（Moscow / Sheremetyevo），慕尼黑（Munich），那不勒斯（Naples），纽卡斯尔（Newcastle），下诺夫哥罗德（Nizhniy Novgorod），新西伯利亚（Novosibirsk），敖德萨（Odessa），奥斯陆（Oslo），俄斯特拉发（Ostrava），巴黎-戴高乐机场（Paris / Charles de Gaulle），彼尔姆市（Perm），比萨（Pisa），里加（Riga），罗马-菲乌米奇诺（Rome/Fiumicino），罗斯托夫（Rostov），鹿特丹（Rotterdam），萨马拉（Samara），首尔-仁川（Seoul / Incheon），索菲亚（Sofia），圣彼得堡（St Petersburg），斯德哥尔摩-阿兰达机场（Stockholm / Arlanda），斯特拉斯堡（Strasbourg），斯图加特（Stuttgart），塔什干（Tashkent），第比利斯（Tbilisi），特拉维夫（Tel Aviv），图卢兹（Toulouse），乌法（Ufa），威尼斯-马可波罗机场（Venice/Marco Polo），威尼斯-特雷维索（Venice/Treviso），维也纳（Vienna），华沙（Warsaw），埃里温（Yerevan），苏黎世（Zurich）。