Prag Havaalanı günde 200 uçuş (pik sezonda bazen 300’e yakın uçuş) idare etmektedir ve yaklaşık 45-50 havayolu tarafından, planlanmış ve charter olarak dünyadaki 83 noktaya (38 ülkedeki) doğrudan bağlantı operasyonları için kullanılır ve bu da onu hatırı sayılır büyüklükte bir havaalanı yapar. Kış zaman çizelgesi yaz çizelgesine göre daha az uçuş görür.
Ayda 1.2 milyona kadar insan havaalanını kullanmaktadır – bu yaklaşık Prag’da yaşayan insan sayısı kadardır. Terminallerden geçen yolcu sayısına göre (yılda 10-12 milyon), Václav Havel Havaalanı Avrupa’daki en üst sıradaki 30 havaalanı arasındadır ve orta Avrupa’daki ikinci en büyük havaalanıdır. Popülerliği Prag’ın orta Avrupa’daki konumundan faydalanan ucuz bütçeye hitap eden havayolları tarafından arttırılmıştır. Prag Havaalanı’nın ucuz uçuşlar arayan yolcuların bir çoğunun tercih ettiği, yakınlardaki Viyana, Münih, Nuremberg ve Dresden Havalimanları gibi başlıca rakipleri olduğunu söylemeye gerek yoktur. Prag Havaalanı’ndaki uçuşların sayısını azaltan başka bir faktör de Çek-sahipli taşıyıcı Çek Havayollarının bir çok noktaya uçuşlarının sayısında ciddi miktarda azaltmaya gitmiş olmasıdır. Yolcu hacmini azaltan en yeni faktör Prag Havaalanı’nın ücretlerinin çok yüksek olması nedeniyle Prag’a uçuş yapmak isteyen bazı düşük maliyetli havayolları ile anlaşma yapılamamasıdır, görüşmeler olumsuz sonuçlanmıştır; örneğin Ryanair ile.
Prag Havaalanı’ndaki başlıca taşıyıcı Çek Havayolları’dır (ČSA), SkyTeam Alliance’ın bir parçasıdır ve genelde Avrupa ve Rus noktalarına uçuşlar düzenler. 2012 ve 2013’te bu taşıyıcı, hizmetlerini Etihat ve Koran Havayolları (şirketin %44 ünü de satın alıp onu muhtemel bir iflastan da kurtamıştır) ile işbirliğine giderek Asya ve Avustralya’ya da genişletmiştir.
Halihazırda Prag Havaalanından doğrudan uçuşların gittiği yerler: Abu Dhabi, Almatı, Amsterdam, Atina, Bakü, Barselona, Bari, Basel / Mulhouse, Berlin / Tegel, Bristol, Brüksel, Bükreş / Otopeni, Budapeşte, Köln, Kopenhag, Donetsk, Dubai, Dublin, Düsseldorf, Edinburgh, Ekaterinburg, Frankfurt , Cenova, Hamburg, Helsinki, İstanbul, Kazan, Kiev / Borispol, Kosice, Krasnodar, Leeds, Lizbon, Londra / Gatwick, Londra / Heathrow, Londra / Luton, Londra / Stansted, Lyon, Madrid, Manchester, Marsilya, Milano / Bergamo , Milan / Malpensa, Minsk, Moskova / Sheremetyevo, Münih, Napoli, Newcastle, Nizhniy Novgorod, Novosibirsk, Odessa, Oslo, Ostrava, Paris / Charles de Gaulle, Perm, Pisa, Riga, Roma / Fiumicino, Rostov, Rotterdam, Samara, Stuttgart, Taşkent, Tiflis, Tel Aviv, Toulouse, Ufa, Venedik / Marco Polo, Venedik / Treviso, Viyana, Varşova, Erivan, Zürih.