Аэропорт Праги обслуживает более 200 рейсов в день (около 300 рейсов в пик сезона) и используется примерно 45-50 авиаперевозчиками, осуществляющими прямые, регулярные и чартерные рейсы в 83 направления по всему миру (в 38 стран), что придает аэропорту особую значимость. В зимнее время выполняется меньше рейсов, чем в летнее.
Основным авиа перевозчиком Пражского аэропорта является авиакомпания Czech Airlines (ČSA), входящая в альянс SkyTeam Alliance. Основными направлениями полетов являются страны Европы и Россия. С 2012 года перевозчик добавил к своим направлениям страны Азии и Австралию путем объединения с Etihad Airways и Koran Air (которая приобрела 44% акций компании и возможно спасла Czech Airlines от банкротства).
В месяц услугами аэропорта пользуется до 1,2 млн. человек, что соизмеримо с населением самой Праги. По количеству пассажиров, проходящих через терминалы (около 10-12 млн. пассажиров в год), аэропорт имени Вацлава Гавела является одним из 30 крупнейших аэропортов в Европе и вторым по величине аэропортом в центральной Европе. Популярность аэропорта возросла благодаря большому числу бюджетных авиакомпаний, пользующихся удобным расположением Праги в Центральной Европе. Излишне говорить, что у Пражского аэропорта есть целый ряд конкурентов в лице близлежащих аэропортов в Вене, Мюнхене, Нюрнберге и Дрездене, а многие пассажиры, предпочитающие более дешевые рейсы, выбирают именно эти аэропорты. Другим фактором, уменьшившим число рейсов в пражском аэропорту, стало значительное сокращение количества рейсов чешскими авиалиниями (Czech Airlines) по многим направлениям. Последним фактором, повлиявшим на объем пассажиров, стали высокие тарифы пражского аэропорта, которые не смогли оплатить некоторые авиакомпании, заинтересованные в полетах в Прагу, поэтому переговоры с некоторыми авиаперевозчиками, например, с Ryanair, не увенчались успехом.
Прямые рейсы из аэропорта Праги в: Абу-Даби, Алматы, Амстердам, Афины, Баку, Барселону, Бари, Базель/Мюлуз, Берлин/Тегель, Бристоль, Брюссель, Бухарест/Отопени, Будапешт, Кельн, Копенгаген, Донецк, Дубай, Дублин, Дюссельдорф, Эдинбург, Екатеринбург, Франкфурт, Женеву, Гамбург, Хельсинки, Стамбул, Казань, Киев/Борисполь, Кошице, Краснодар, Лидсе, Лиссабон, Лондон/Гатвик, Лондон/Хитроу, Лондон/Лутон, Лондон/ Станстед, Лион, Мадрид, Манчестер, Марсель, Милан/Бергамо, Милан/Мальпенса, Минск, Москву/Шереметьево, Мюнхен, Неаполь, Ньюкасл, Нижний Новгород, Новосибирск, Одессу, Осло, Остраву, Париж/Шарль де Голль, Пермь, Пизу, Ригу, Рим/Фьюмичино, Ростов, Роттердам, Самару, Сеул/Инчхон, Софию, Санкт-Петербург, Стокгольм/Арланда, Страсбург, Штутгарт, Ташкент, Тбилиси, Тель-Авив, Тулузу, Уфу, Венецию/Марко Поло, Венецию/Тревизо, Вену, Варшаву, Ереван, Цюрих.
