Aeroportul Praga gestionează în jur de 200 de zboruri pe zi (în perioadele de sezon de vârf până la 300) și este folosit de aproximativ 45-50 de companii ce oferă zboruri directe, programate și charter, spre 83 de destinații din lume (în 38 de țări), ceea ce îl face un aeroport mare. Orarele din timpul iernii nu sunt așa de pline ca cele din perioada verii.
Aeroportul este folosit de până la 1,2 milioane de oameni pe lună – cam tot atâția oameni câți trăiesc în Praga. În funcție de numărul de pasageri care trec prin terminale (în jur la 10-12 milioane de pasageri pe an) Aeroportul Václav Havel este printre primele 30 de aeroporturi din Europa și al doilea ca mărime din Europa centrală. Popularitatea lui a crescut din cauza numărului de linii buget care profită de locația central europeană a Pragăi. Inutil să mai spunem, Aeroportul Praga are competitori majori în aeroporturile vecine, cum ar fi Viena, München, Nürnberg și Dresda, mulți pasageri alegând să ia zboruri mai ieftine mai degrabă din aceste locații decât din Praga. Un alt factor care a redus numărul de zboruri la Aeroportul Praga este faptul că compania cehă Liniile Cehe a redus semnificativ numărul zborurilor sale către multe destinații. Cel mai recent factor care a influențat volumul pasagerilor este faptul că multe linii aeriene care oferă costuri reduse și care au fost interesate să zboare la Praga nu au reușit să ajungă la o înțelegere, întrucât Aeroportul Praga are încă taxe mari, și astfel negocierile nu au dus la nici un rezultat; de exemplu, Ryanair.
Linia aeriană principală din Aeroportul din Praga este Liniile Cehe (ČSA), parte din SkyTeam Alliance, ce oferă zboruri în special către destinații din Europa și Rusia. În 2012 și 2013, această companie și-a extins serviciile în Asia și Australia, în cooperare cu Liniile Etihad și Koran Air (care a cumpărat 44% din acțiunile companiei și, probabil, a salvat-o de la faliment).
Zborurile curente oferite de Aeroportul din Praga sunt spre: Abu Dhabi, Almaty, Amsterdam, Atena, Baku, Barcelona, Bari , Basel / Mulhouse, Berlin / Tegel, Bristol, Bruxelles, București / Otopeni, Budapesta, Köln, Copenhaga, Donetsk, Dubai, Dublin, Düsseldorf, Edinburgh, Ekaterinburg, Frankfurt, Geneva, Hamburg, Helsinki, Istanbul, Kazan, Kiev / Borispol, Cașovia, Krasnodar, Leeds, Lisabona, Londra / Gatwick, Londra / Heathrow, Londra / Luton, Londra / Stansted, Lyon, Madrid, Manchester, Marsilia, Milano / Bergamo, Milano / Malpensa, Minsk, Moscova / Sheremetyevo, München, Napoli , Newcastle, Nijni Novgorod, Novosibirsk, Odessa, Oslo, Ostrava, Paris / Charles de Gaulle, Perm, Pisa, Riga, Roma / Fiumicino, Rostov, Rotterdam, Samara, Seul / Incheon, Sofia, St Petersburg, Stockholm / Arlanda, Strasbourg, Stuttgart, Tașkent, Tbilisi, Tel Aviv, Toulouse, Ufa, Veneția / Marco Polo, Veneția / Treviso, Viena, Varșovia, Yerevan, Zürich.