Det er tre skilt ved passkontrollen: 1) Ikke-EU, 2) Kun EU og 3) Bare EU, men med prioritet for diplomatisk personale og flybesetninger. De fleste nasjonaliteter trenger ikke visum for å komme inn i landet, men du kan sjekke dette her. Sammenlignet med andre EU-flyplasser, kan passkontrollen noen ganger være ganske treg (dette er mest sannsynlig å være tilfelle dersom du kommer i rushtiden, 10:00-14:00). Det er 12 pass porter, men generelt sett er ikke alle av dem aktive på en gang. Totalt sett er sikkerheten på flyplassen i Praha tøff, men effektiv.
Hvis du kommer fra innenfor Schengen-sonen (alle flyvninger til / fra Terminal 2), er det ingen passkontroll. De fleste EU-landene er nå en del av Schengen (unntatt Storbritannia).
Praha Flyplass E-Gate
Praha Flyplass tilbyr reisende mulighet for automatisk passskontroll gjennom den såkalte «E-Gate». Basert på Easy Go-teknologien kan passasjerer fra EU, EØS og Sveits dra nytte av selvbetjeningskontrollen, forutsatt at de er har et biometrisk pass og er over 18 år. Fra start til slutt, varer hele sjekkprosessen i E-Gate i 12 -20 sekunder. Utnyttelsen av den nye teknologien vil øke flyplassens passkontrollkapasitet. E-Gate er tilgjengelig for passasjerer som ankommer i Terminal 1 (passasjerer som ankommer i Terminal 2 trenger ikke å passere innvandring ettersom alle flyvninger er fra Schengen-sonen).