Pašlaik Prāgas lidosta nav tieši savienota ar dzelzceļu. Lai gan tiek plānots tieši savienot lidostu ar vilcienu, tā netiks uzbūvēta ātrāk par 2021. gadu, un ir paredzēts, ka viss projekts tiks pabeigts 2028.–2030.
Pirmie paziņotie plāni par dzelzceļa pagarināšanu vedīs no Prāgas 6 (Veļeslavina, no kurienes tagad kursē autobusi uz lidostu) uz Václava Havela lidostu, un turpmākās līnijas turpināsies uz Kladno. Dzelzceļš tieši savienotu lidostu ar pilsētas centru Prāgas Masarykovo nádraží stacijā. Maksimālajos laikos seši vilcieni stundā varētu veikt 27 minūšu braucienu tikpat ātri kā brauciens ar taksometru. Vilcieni uz Veleslavín lidostā var nokļūt tikai 11 minūšu laikā.
Šobrīd vienkāršākais veids, kā nokļūt Prāgas galvenajā dzelzceļa stacijā (Praha hlavní nádraží), no kurienes ir tiešs transfērs uz vilcienu, kas kursē uz citiem galamērķiem Čehijas Republikā un ārvalstīs, ir izmantot Airport Express autobusu.
AE autobusu pieturas atrodas tieši pretī termināļa ēkai 1. un 2. terminālī (nav paredzēta iekāpšanai). Ja ierodaties 2. terminālī, lūdzu, ņemiet vērā, ka AE autobuss atiet tikai no 1. termināļa. Ceļojuma laiks uz turieni ir aptuveni 25 līdz 35 minūtes atkarībā no satiksmes.
Lai izmantotu šo pakalpojumu, ir jāiegādājas Airport Express autobusa biļetes. Biļetes var iegādāties tieši pie autobusa vadītāja vai apmeklētāju centrā ielidošanas zālē. Lūdzu, ņemiet vērā, ka sabiedriskā transporta biļetes (MHD) šajā pakalpojumā nav derīgas.