Prāgas lidosta apkalpo vairāk nekā 200 lidojumus dienā (augstajā sezonā dažkārt pat gandrīz 300 lidojumus), un to izmanto aptuveni 45 līdz 50 pārvadātāji, kas veic tiešos lidojumus, regulāros un čartera reisus uz 83 galamērķiem visā pasaulē (38 valstīs), padarot to par nozīmīgu transporta mezglu. Ziemas lidojumu sarakstā mēdz būt mazāk reisu nekā vasaras lidojumu sarakstā.
Lidostu izmanto līdz pat 1,2 miljoniem cilvēku mēnesī – aptuveni tāds pats ir Prāgas iedzīvotāju skaits. Rēķinot pēc pasažieru skaita, kas iziet caur termināļiem (aptuveni 10-12 miljoni pasažieru gadā), Vāclava Havela lidosta ir viena no 30 lielākajām lidostām Eiropā un otrā lielākā lidosta Centrāleiropā. Tās popularitāti ir palielinājusi virkne budžeta aviosabiedrību, kas izmanto Prāgas ērto izvietojumu centrālajā Eiropā. Lieki teikt, ka Prāgas lidostai ir vairāki nozīmīgi konkurenti tuvējo lidostu formā, tādu kā Vīnes, Minhenes, Nirnbergas un Drēzdenes lidostas, daudziem pasažieriem meklējot lētākus lidojumus un izvēloties lidot no šīm lidostām, nevis no Prāgas. Vēl viens faktors, kas samazina Prāgas lidostas apkalpoto lidojumu skaitu, ir tas, ka čehu pārvadātājs Czech Airlines ir ievērojami samazinājis savu lidojumu skaitu uz daudziem galamērķiem. Nesens faktors, kas ietekmē pasažieru apjomu, ir tas, ka dažas zemo cenu aviosabiedrības, kuras bija ieinteresētas lidot uz Prāgu, nespēja panākt vienošanos ar Prāgas lidostu, kura vēl joprojām ietur ļoti augstas maksas. Tā, piemēram, šī iemesla dēļ izgāzās pārrunas ar Ryanair.
Galvenais Prāgas lidostas pārvadātājs ir Czech Airlines (ČSA), kas ietilpst SkyTeam Alliance un veic lidojumus galvenokārt uz Eiropas un Krievijas galamērķiem. 2012. un 2013. gadā šis pārvadātājs paplašināja savus pakalpojumus Āzijā un Austrālijā sadarbībā ar Etihad Airways un Korean Air (kas faktiski iegādājās 44% no uzņēmuma akcijām un, iespējams, paglāba uzņēmumu no bankrota).
Pašreiz tiešie reisi no Prāgas lidostas dodas uz: Abū Dabī, Almati, Amsterdamu, Atēnām, Baku, Barselonu, Bari, Bāzeli/Milūzu, Berlīni/Tēgeli, Bristoli, Briseli, Bukaresti/Otopeni, Budapeštu, Ķelni, Kopenhāgenu, Doņecku, Dubaju, Dublinu, Diseldorfu, Edinburgu, Jekaterinburgu, Frankfurti, Ženēvu, Hamburgu, Helsinkiem, Stambulu, Kazaņu, Kijevu/Borispiļu, Košici, Krasnodaru, Līdsu, Lisabonu, Londonu/Getviku, Londonu/Hītrovu, Londonu/Lūtonu, Londonu/Stanstedu, Lionu, Madridi, Mančestru, Marseļu, Milānu/Bergamo, Milānu/Malpensu, Minsku, Maskavu/Šeremetjevo, Minheni, Neapoli, Ņūkāslu, Ņižņijnovgorodu, Novosibirsku, Odesu, Oslo, Ostravu, Parīzi/Šarla de Golla lidostu, Permu, Pizu, Rīgu, Romu/Fjumičīno, Rostovu, Roterdamu, Samāru, Seulu/Inčhonu, Sofiju, Sanktpēterburgu, Stokholmu/Arlandu, Strasbūru, Štutgarti, Taškentu, Tbilisi, Telavivu, Tulūzu, Ufu, Venēciju/Marko Polo lidostu, Venēciju/Trevīzo, Vīni, Varšavu, Erevānu un Cīrihi.
