프라하 공항에는 하루에 200개 이상(성수기에는 때때로 거의 300개)의 항공편이 운항되며, 전세계(38개국) 83개의 도시로 직항, 정기, 전세 운행을 하는 대략 40개에서 50개의 항공사가 프라하 공항을 이용해서, 이 공항을 상당히 큰 공항으로 만들어 준다. 겨울 일정표는 여름 일정표에서 보이는 것보다 더 적은 수의 항공편이 운항되는 것으로 보여준다.
매달 1백 2십만의 사람들이 공항을 이용한다 – 이 수는 프라하에 살고 있는 사람의 수와 거의 비슷하다. 터미널을 통과하는 승객의 수(매년 약 천만에서 천이백만 의 승객)에 근거해, Vaclav Havel 공항은 유럽의 상위 30내에 들고 중유럽에서 두 번째로 큰 공항이다. 공항의 인기는 프라하가 중유럽에 위치한 것에서 이익을 얻는 저가 항공사의 수에 의해 증폭된다. 말할 필요도 없이, 프라하 공항에는 비엔나, 뮌헨, Nuremberg 과 Dresden 등의 근처 공항과 같은 주요 경쟁자가 있는데, 많은 승객들이 더 싼 항공편을 찾아 프라하 공항보다 이런 공항에서 출발하는 것을 선택한다. 프라하 공항의 항공편 수 감소의 또 다른 요인은 체코 소유의 항공사 체코 에어라인이 많은 목적지로 가는 항공편의 수를 상당히 줄였기 때문이다. 가장 최근에 승객 수에 영향을 준 요소는 프라하로 운항하는 것에 관심을 보였던 몇몇 저가 항공사들이 프라하 공항이 여전히 상당히 높은 수수료를 부가해서, 합의에 도달하지 못해 협상에 실패한 것이다; 그 예로 Ryanair가 있다.
프라하 공항의 주요 항공사는SkyTeam 연맹에서 주로 유럽과 러시아 행 항공편을 운행하는 체코 에어라인(ČSA)이다. 2012 과 2013년에 이 항공사는Etihad Airways 및 Koran Air(이 항공사는 회사 주식의 44%를 매입해서 회사를 가능한 파산에서 구했다)와 연합하여 아시아와 호주까지 그 서비스를 확장했다.
현재 프라하 공항 에서 직항이 운행되는 곳: Abu Dhabi, Almaty, 암스테르담, 아테네, Baku, 바르셀로나, Bari , Basel / Mulhouse, 베를린 / Tegel, Bristol, Brussels, Bucharest / Otopeni, 부다페스트, Cologne, 코펜하겐, Donetsk, 두바이, Dublin, Dusseldorf, Edinburgh, Ekaterinburg, 프랑크푸르트, 제네바, 함부르크, Helsinki, 이스탄불, Kazan, Kiev / Borispol, Kosice, Krasnodar, Leeds, 리스본, 런던 / Gatwick, 런던 / Heathrow, 런던 / Luton, 런던 / Stansted, 리옹, 마드리드, 맨체스터, 마르세이유, 밀라노 / Bergamo, 밀라노 / Malpensa, Minsk, 모스크바 / Sheremetyevo, 뮌헨, 네팔, Newcastle, Nizhniy Novgorod, Novosibirsk, Odessa, 오슬로, Ostrava, 파리 / Charles de Gaulle, Perm, 피사, Riga, 로마/Fiumicino, Rostov, Rotterdam, Samara, 서울 / 인천, Sofia, St Petersburg, 스톡홀롬 / Arlanda, Strasbourg, Stuttgart, Tashkent, Tbilisi, Tel Aviv, Toulouse, Ufa, 베니스 / 마르코 폴로, 베니스/Treviso, 비엔나, Warsaw, Yerevan, 취리히.