A prágai repülőtér naponta több mint 200 járatot kezel (főszezonban néha közel 300-at) és hozzávetőlegesen 45-50 közvetlen csatlakozásokat működtető légi fuvarozó használja a menetrendszerinti és a charter járatok indítására a világ mintegy 83 úti céljához (38 országban), amely figyelemre méltó repülőtérré teszi. A téli menetrend idején kevesebb járat közlekedik, mint a nyári menetrend alatt.
Egy hónapban mintegy 1.2 millió ember használja a repülőteret – ez a szám nagyjából megegyezik Prága lakosságával. A terminálokon keresztülhaladó utasok száma alapján (kb. 10-12 millió utas egy évben), a Václav Havel repülőtér Európa első 30 repülőtere között van és Közép-Európa második legnagyobb repülőtere. Népszerűségét megnövelte a Prága közép-európai elhelyezkedésének előnyeit kihasználó számos fapados légitársaság. Mondanunk sem kell, hogy a prágai repülőtérnek van néhány fő konkurense az olyan közeli repterek közül kerül ki, mint a bécsi, a müncheni, a nürnbergi és a drezdai, mivel sok utas, aki olcsóbb járatot keres, a prágai helyett inkább ezekről a repterekről indul. Egy másik, a prágai repülőtéren a járatok számát csökkentő tényező, hogy a cseh tulajdonban lévő légi fuvarozó, a Cseh Légitársaság jelentősen megritkította több célállomás irányában közlekedő a járatai számát. A legutolsó, az utasok számát befolyásoló tényező, hogy a Prágába repülés iránt érdeklődő, a Ryanairhez hasonló diszkont légitársaságok, a prágai repülőtér még mindig nagyon magas díjai miatt nem tudtak egyezségre jutni, így a tárgyalások kudarcba fulladtak.
A prágai reptéren a fő légi fuvarozó a Cseh Légitársaság (ČSA), amely a SkyTeam légiszövetség tagjaként járatait főként európai és orosz úti célok felé indítja. 2012-ben és 2013-ban ez a légi fuvarozó, együttműködésben az Etihad Airways-el és a Koran Air-rel (amely valójában felvásárolta a részvényeinek 44%-át és talán megmentette a vállalatot a csődtől) kiterjesztette szolgáltatásait Ázsiára és Ausztráliára.
A prágai reptérről jelenleg a következő helyekre indulnak közvetlen járatok: Abu-Dzabi, Almati, Amszterdam, Athén, Baku, Barcelona, Bari, Bázel / Mulhouse, Berlin / Tegel, Bristol, Brüsszel, Bukarest / Otopeni, Budapest, Köln, Koppenhága, Doneck, Dubaj, Dublin, Düsseldorf, Edinburgh, Jekatyerinburg, Frankfurt, Genf, Hamburg, Helsinki, Isztambul, Kazán, Kijev / Boriszpil, Kassa, Krasznodar, Leeds, Lisszabon, London / Gatwick, London / Heathrow, London / Luton, London / Stansted, Lyon, Madrid, Manchester, Marseille, Milánó / Bergamo, Milánó / Malpensa, Minszk, Moszkva / Sheremetyevo, München, Nápoly, Newcastle, Nyizsnyij Novgorod, Novoszibirszk, Odessza, Oslo, Ostrava, Párizs / Charles de Gaulle, Perm, Pisa, Riga, Róma / Fiumicino, Rosztov, Rotterdam, Szamara, Szöul / Incheon, Szófia, Szentpétervár, Stockholm / Arlanda, Strasbourg, Stuttgart, Taskent, Tbiliszi, Tel-Aviv, Toulouse, Ufa, Velence / Marco Polo, Velence / Treviso, Bécs, Varsó, Jereván, Zürich.
