הטרמינלים של נמל התעופה של פראג
טרמינל 1 – טיסות בינלאומיות, כולל טיסות מבריטניה, מאירלנד, מצפון אמריקה (ארה"ב וקנדה), מהמזרח התיכון, מאפריקה ומאסיה.
טרמינל 2 – טיסות ממדינות האיחוד האירופי שחתמו על הסכם שנגן ומיעדים אחרים באירופה.
טרמינל 3 – טיסות שכר ומטען וטיסות פרטיות. ביקורים רשמיים או אירועים גדולים.
בנמל התעופה יש שלושה טרמינלים : טרמינל 1, טרמינל 2 וטרמינל 3. בטרמינל 1 ובטרמינל 2 יש המראות ונחיתות של טיסות בינלאומיות ומקומיות ואילו טרמינל 3 משרת בעיקר טיסות רגילות וטיסות עסקים. בכל הטרמינלים אולם הנוסעים הנכנסים ואולם הנוסעים היוצאים צמודים זה לזה ונמצאים באותה קומה. המעבר מטרמינל לטרמינל נעשה בעזרת מיניבוס או מונית. כל הטיסות ממדינות האיחוד האירופי שחתמו על הסכם שנגן (כגון ספרד וגרמניה) מגיעות לטרמינל 2. טיסות ממדינות שאינן חתומות על ההסכם (כגון ארצות הברית ובריטניה) מגיעות לטרמינל 1. טרמינל 2 החדש, שפתח את שעריו בשנת 2006, מציע לנוסעים שירותים מגוונים וכולל שישה בניינים. בטרמינל זה נותנים שירותים בעיקר לטיסות המגיעות ממדינות האיחוד האירופי.
לאחר השקתו של טרמינל 2 התקדם נמל התעופה של פראג משמעותית ביכולתו להציע שירותים מודרניים וטיפול יעיל המאפשר להגדיל את תפוסת התעבורה בנמל התעופה, שהופך להיות אחד ממוקדי התעופה האזרחית במרכז ובמזרח אירופה. השקעות מתוכננות נוספות הקשורות לטרמינל זה יסייעו להוביל עוד מבקרים אל פראג ולהכפיל תוך כעשרים שנה את מספר הנוסעים ל-20 מיליון בשנה.