L’Aéroport de Prague gère plus de 200 vols par jour (en haute saison parfois près de 300), et il est utilisé par environ 45 à 50 compagnies aériennes avec des connexions directes, des vols réguliers ou affrétés, vers 83 destinations dans le monde (dans 38 pays), ce qui en fait un aéroport d’une certaine ampleur. En hiver, il y a moins de vols qu’en été.
La compagnie aérienne majeure de l’Aéroport de Prague est Czech Airlines (ČSA), qui fait partie de SkyTeam Alliance, et elle propose des vols majoritairement à destination de l’Europe et de la Russie. En 2012 et en 2013, cette compagnie a étendu ses services à l’Asie et à l’Australie en coopération avec Etihad Airways et Koran Air (qui ont en réalité acheté 44% des actions de la société, sauvant probablement sauvé cette dernière de la faillite).
Jusqu’à 1,2 million de personnes utilisent l’aéroport chaque mois – environ le nombre d’habitants de Prague. De par le nombre de personnes transitant par les terminaux (environ 10 à 12 millions de passagers par an), l’Aéroport Václav Havel fait partie des 30 meilleurs aéroports d’Europe, et il s’agit du deuxième aéroport le plus grand d’Europe Centrale. Sa popularité a été renforcée par le nombre de compagnies aériennes bon marché qui profitent du fait que Prague soit située en Europe Centrale. Il va s’en dire que l’Aéroport de Prague dispose de concurrents majeurs sous la forme des aéroports situés à proximité, comme ceux de Vienne, de Munich, de Nuremberg et de Dresde, avec de nombreux passagers qui recherchent des vols à bas prix choisissant de partir de ces aéroports plutôt que de Prague. La compagnie aérienne tchèque Czech Airlines a grandement réduit le nombre de ses vols vers de nombreuses destinations, ce qui constitue un autre facteur réduisant le nombre de vols de l’Aéroport de Prague. Le dernier facteur qui influence le volume des passagers est lié au fait que certaines compagnies aériennes low-cost qui étaient intéressées par des vols à destination de Prague ne sont pas parvenues à trouver un accord avec l’Aéroport de Prague dont les tarifs sont très élevés. Les négociations échouèrent, comme par exemple avec Ryanair.
Vols directs actuellement au départ de l’Aéroport de Prague vers les destinations suivantes : Abou Dhabi, Almaty, Amsterdam, Athènes, Bakou, Barcelona, Bari , Basel / Mulhouse, Berlin / Tegel, Bristol, Bruxelles, Bucarest / Otopeni, Budapest, Cologne, Copenhague, Donetsk, Dubaï, Dublin, Düsseldorf, Édimbourg, Ekaterinbourg, Francfort, Genève, Hambourg, Helsinki, Istanbul, Kazan, Kiev / Borispol, Kosice, Krasnodar, Leeds, Lisbonne, Londres / Gatwick, Londres / Heathrow, Londres / Luton, Londres / Stansted, Lyon, Madrid, Manchester, Marseille, Milan / Bergame, Milan / Malpensa, Minsk, Moscou / Cheremetièvo, Munich, Naples, Newcastle, Nijni Novgorod, Novossibirsk, Odessa, Oslo, Ostrava, Paris / Charles de Gaulle, Perm, Pisa, Riga, Rome/Fiumicino, Rostov, Rotterdam, Samara, Séoul / Incheon, Sofia, Saint-Pétersbourg, Stockholm / Arlanda, Strasbourg, Stuttgart, Tachkent, Tbilissi, Tel Aviv, Toulouse, Ufa, Venise/Marco Polo, Venise/Trévise, Vienne, Varsovie, Erevan, Zurich.