Tällä hetkellä Prahan lentoasemaa ei ole suoraan yhteydessä mihinkään rautatiehen. Vaikka lentoaseman suora liittäminen junayhteyteen on suunnitteilla, sitä ei tulla rakentamaan ennen vuotta 2020, ja koko projektin odotetaan valmistuvan vuonna 2023–24.
Ensimmäiset julkaistut suunnitelmat rautatien laajennuksesta johtaisivat sijainnista Praha 6 (Veleslavín, josta linja-autot kulkevat tällä hetkellä lentoasemalle) Václav Havelin lentoasemalle, josta linjat jatkuvat edelleen Kladnoon. Rautatie yhdistäisi lentoaseman suoraan kaupungin keskustaan, Prahan Masarykovo nádraží -asemalle. Huippuaikoina kuusi junaa tunnissa voisi tehdä 27 minuutin matkan yhtä nopeasti kuin taksimatka kestää. Junien Veleslavíniin tulisi saavuttaa lentoasema vain 11 minuutissa.
Tällä hetkellä helpoin tapa päästä Prahan päärautatieasemalle (Praha hlavní nádraží), josta on käytettävissä suora siirto junaliikenteeseen muille kohteille Tšekin tasavallassa ja ulkomailla, on käyttää Airport Express -bussia.
AE-väylän pysäkit sijaitsevat suoraan terminaalirakennuksen edessä terminaalissa 1 ja terminaalissa 2 (ei kyytiin nousemista varten). Jos saavut terminaaliin 2, ole hyvä ja huomioi, että AE-bussi lähtee vain terminaalista 1. Matka-aika paikalle on noin 25–35 minuuttia liikenteestä riippuen.
Tämän palvelun käyttämiseksi on ostettava Airport Express -bussiliput. Lippuja voi ostaa suoraan linja-autonkuljettajalta tai saapumishallin vierailijakeskuksesta. Huomaathan, että julkisen liikenteen liput (MHD) eivät ole voimassa tämän palvelun yhteydessä.