Το Αεροδρόμιο της Πράγας χειρίζεται πάνω από 200 πτήσεις την ημέρα (σε περίοδο αιχμής μερικές φορές σχεδόν 300) και χρησιμοποιείται από περίπου 45 έως 50 αερομεταφορείς που εκτελούν απευθείας συνδέσεις, προγραμματισμένες και τσάρτερ, σε 83 προορισμούς σε όλο τον κόσμο (σε 38 χώρες), γεγονός που το καθιστά ένα αρκετά μεγάλο αεροδρόμιο. Το χειμερινό χρονοδιάγραμμα τείνει να περιέχει λιγότερες πτήσεις από ό,τι το καλοκαιρινό χρονοδιάγραμμα.
Έως και 1,2 εκατομμύρια άνθρωποι το μήνα χρησιμοποιούν το αεροδρόμιο – περίπου όσο είναι ο αριθμός των ανθρώπων που ζουν στην Πράγα. Με βάση τον αριθμό των επιβατών που διακινούνται μέσω των τερματικών (γύρω στα 10-12 εκατομμύρια επιβάτες το χρόνο), το Αεροδρόμιο Vaclav Havel είναι μεταξύ των κορυφαίων 30 αεροδρομίων στην Ευρώπη και το δεύτερο μεγαλύτερο αεροδρόμιο της κεντρικής Ευρώπης. Η δημοτικότητα του έχει ενισχυθεί από τον αριθμό των αεροπορικών γραμμών που προσφέρουν χαμηλές τιμές και επωφελούνται από την κεντρική ευρωπαϊκή θέση της Πράγας. Περιττό να πούμε ότι, το Αεροδρόμιο της Πράγας έχει ορισμένους βασικούς ανταγωνιστές με τη μορφή πλησιέστερων αεροδρομίων όπως η Βιέννη, το Μόναχο, η Νυρεμβέργη και η Δρέσδη, με πολλούς επιβάτες να αναζητούν για φτηνότερες πτήσεις επιλέγοντας να αναχωρήσουν από εκείνα τα αεροδρόμια και όχι από την Πράγα. Ένας άλλος παράγοντας για τη μείωση του αριθμού των πτήσεων στο Αεροδρόμιο της Πράγας είναι ότι οι Τσεχικές Αερογραμμές που ανήκουν σε Τσεχικούς μεταφορείς μείωσαν σημαντικά τον αριθμό των πτήσεων τους σε πολλούς προορισμούς. Ο τελευταίος παράγοντας που επηρεάζει τον όγκο των επιβατών είναι ότι ορισμένες αεροπορικές εταιρείες χαμηλού κόστους που ενδιαφέρονταν για πτήσεις προς την Πράγα δεν μπόρεσαν να καταλήξουν σε μια συμφωνία καθώς το Αεροδρόμιο της Πράγας εξακολουθεί να έχει πολύ υψηλές αμοιβές, οπότε οι διαπραγματεύσεις απέτυχαν, για παράδειγμα, με την Ryanair.
Ο μεγάλος αερομεταφορέας στο Αεροδρόμιο της Πράγας είναι οι Czech Airlines (ČSA), μέρος της SkyTeam Alliance, και πραγματοποιεί πτήσεις κυρίως προς Ευρωπαϊκούς και Ρωσικούς προορισμούς. Το 2012 και το 2013 ο μεταφορέας αυτός επέκτεινε τις υπηρεσίες του προς την Ασία και την Αυστραλία σε συνεργασία με την Etihad Airways και την Koran Air (που όντως αγόρασε 44% των μετοχών της εταιρείας και ενδεχομένως έσωσε την εταιρεία από πτώχευση).
Τρέχουσες απευθείας πτήσεις που διεξάγονται από το Αεροδρόμιο της Πράγας πετούν προς: Αμπού Ντάμπι, Αλμάτι, Άμστερνταμ, Αθήνα, Μπακού, Βαρκελώνη, Μπάρι , Μπάσελ / Μούλχαουζ, Βερολίνο / Τέγκελ, Μπρίστολ, Βρυξέλλες, Βουκουρέστι / Οτοπένι, Βουδαπέστη, Κολωνία, Κοπεγχάγη, Ντονέτσκ, Ντουμπάι, Δουβλίνο, Ντίσελντορφ, Εδιμβούργο, Αικατερινούπολη, Φραγκφούρτη, Γενεύη, Αμβούργο, Ελσίνκι, Κωνσταντινούπολη, Καζάν, Κίεβο / Μπόρισπολ, Κόσιτσε, Κράσνονταρ, Λιντς, Λισσαβώνα, Λονδίνο/Γκάτουικ, Λονδίνο/Χίθροου, Λονδίνο / Λουτόν, Λονδίνο/Στάνστεντ, Λυών, Μαδρίτη, Μάντσεστερ, Μασσαλία, Μιλάνο / Μπέργκαμο, Μιλάνο / Μαλπένσα, Μινσκ, Μόσχα / Σερεμετίεβο, Μόναχο, Νάπολη, Νιούκαστλ, Νίζνι Νόβγκοροντ, Νοβοσιμπίρσκ, Οδησσό, Όσλο, Οστράβα, Παρίσι / Σαρλς ντε Γκολ, Περμ, Πίζα, Ρίγα, Ρώμη/Φιουμιτσίνο, Ροστόβ, Ρόττερνταμ, Σαμάρα, Σεούλ /Ίντσεον /, Σόφια, Αγία Πετρούπολη, Στοκχόλμη / Αρλάντα, Στρασβούργο, Στουτγάρδη, Τασκέντ, Τιφλίδα, Τελ Αβίβ, Τουλούζη, Ούφα, Βενετία/Μάρκο Πόλο, Βενετία/Τρεβίζο, Βιέννη, Βαρσοβία, Ερεβάν, Ζυρίχη.
