Летище Прага обслужва над 200 полета дневно (в силния сезон понякога почти 300) и се използва от около 45 – 50 превозвача, обслужващи директни линии, такива по разписание, както и чартърни полети, до 83 различни дестинации по целия свят (в 38 страни). Това прави летището доста голямо. Зимното разписание обикновено включва по-малко обслужвани полети в сравнение с лятното разписание.
До 1.2 милиона души на месец използват летището – приблизително същия брой души живеят в самата Прага. На базата на броя на пасажерите, които минават през терминалите (около 10-12 милиона пътници годишно), Летище „Вацлав Хавел“ е сред 30-те топ летища в Европа и второто най-голямо летище в Централна Европа. Неговата популярност се увеличи значително от броя на нискотарифните въздушни превозвачи, които се възползват от разположението на Прага в самия център на Европа. Разбира се, Летище Прага има някои основни конкуренти в региона, в лицето на близките летища във Виена, Мюнхен, Нюремберг и Дрезден, като много пътници, които търсят по-евтини полети, избират да отпътуват именно от тези летища, а не от Летище Прага. Друг фактор, който намалява броя на полетите на Летище Прага е, че чешкият превозвач, Чешки Авиолинии, значително намали броя на полетите си до много дестинации.
Най-новият фактор, който влияе върху броя на пътниците, е, че някои нискотарифни авиокомпании, които преди проявяваха интерес към полетите до Прага, не успяха да постигнат споразумение с Летище Прага, тъй като аерогарата все още предлага доста високи такси, така че преговорите пропаднаха; такъв превозвач например е Райанеър (Ryanair).
Водещият въздушен превозвач на Летище Прага са Чешките Авиолинии (ČSA), част от SkyTeam Alliance, опериращ най-вече с полети до дестинации в Европа и Русия. През 2012 и 2013 г. този превозвач разшири услугите си с полети до Азия и Австралия в партньорство с Etihad Airways и Koran Air (последната от които всъщност купи 44% от акциите на чешката компания и така вероятно я спаси от банкрут).
Настоящи директни полети, обслужвани от Летище Прага, летят до: Абу Даби, Алмати, Амстердам, Атина, Баку, Барселона, Бари , Базел / Мюлхауз, Берлин / Тегел, Бристол, Брюксел, Букурещ / Отопени, Будапеща, Кьолн, Копенхаген, Донецк, Дубай, Дъблин, Дюселдорф, Единбург, Екатерининбург, Франкфурт, Женева, Хамбург, Хелзинки, Истанбул, Казан, Киев / Бориспол, Кошице, Краснодар, Лийдс, Лисабон, Лондон / Гетуик, Лондон / Хийтроу, Лондон / Лутън, Лондон / Станстед, Лион, Мадрид, Манчестър, Марсилия, Милано / Бергамо, Милано / Малпенза, Минск, Москва / Шереметьево, Мюнхен, Неапол, Нюкясъл, Нижний Новгород, Новосибирск, Одеса, Осло, Острава, Париж / Шарл дьо Гол, Перм, Пиза, Рига, Рим/Фиумичино, Ростов, Ротердам, Самара, Сеул / Инчеон, София, Санкт Петербург, Стокхолм / Арланда, Страсбург, Щутгарт, Ташкент, Тбилиси, Тел Авив, Тулуза, Уфа, Венеция/Марко Поло, Венеция/Тревизо, Виена, Варшава, Ереван, Цюрих.